Thực hiện Quyết định số 512/QĐ-TTg, ngày 29 tháng 4 năm 2012 của Thủ tướng Chính phủ Về giao dự toán ngân sách trung ương thực hiện các chương trình mục tiêu quốc gia năm 2012; Bộ trưởng Bộ kế hoạch và Đầu tư đã ban hành Quyết định số 540/QĐ-BKHĐT, ngày 03 tháng 5 năm 2012 Về việc giao mục tiêu, nhiệm vụ và vốn các chương trình mục tiêu quốc gia năm 2012.
Theo đó, năm 2012 tỉnh Kon Tum được Trung ương phân bổ 245.381 triệu đồng để thực hiện 13 Chương trình mục tiêu quốc gia, trong đó vốn đầu tư phát triển 89.737 triệu đồng; vốn sự nghiệp 155.644 triệu đồng (chưa bao gồm vốn vay bổ sung Quỹ quốc gia giải quyết việc làm 5.500 triệu đồng cấp qua Ngân hàng Chính sách xã hội).
Hiện nay, các ngành chức năng đang phân bổ chi tiết cho các nhiệm vụ, dự án của từng chương trình để trình cấp có thẩm quyền xem xét, quyết định.