Ngày 26 tháng 11 năm 2013, Thủ tướng Chính phủ đã ban hành Quyết định số 72/2013/QĐ-TTg về quy định cơ chế, chính sách tài chính đối với khu kinh tế cửa khẩu.

Theo đó, Thủ tướng Chính phủ quy định rõ chính sách đầu tư và tín dụng đầu tư xây dựng kết cấu hạ tầng kỹ thuật và kết cấu hạ tầng xã hội trong khu kinh tế; cụ thể đối với nguồn vốn đầu tư hạ tầng của Ngân sách nhà nước;  vốn huy động; vốn từ quỹ đất khu kinh tế; vốn tín dụng nhà nước; ...

Quyết định cũng quy định chính sách ưu đãi về thuế thu nhập doanh nghiệp, thuế thu nhập cá nhân, thuế giá trị gia tăng, thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu, ưu đãi về tiền thuê đất, thuê mặt nước, ưu đãi về thu tiền sử dụng đất và các chính sách về phí, lệ phí, ...

Ngoài ra, Quyết định còn quy định về chính sách khai thác, sử dụng công trình hạ tầng khu kinh tế cửa khẩu.

Quyết định có hiệu lực thi hành kể từ ngày 15 tháng 1 năm 2014 và thay thế Quyết định 33/2009/QĐ-TTg ngày 02 tháng 3 năm 2009 của Thủ tướng Chính phủ ban hành cơ chế, chính sách tài chính đối với khu kinh tế cửa khẩu; thay thế Quyết định 93/2009/QĐ-TTg ngày 10 tháng 7 năm 2009 của Thủ tướng Chính phủ sửa đổi, bổ sung khoản 4 điều 21 Quyết định 33/2009/QĐ-TTg ngày 02 tháng 3 năm 2009 của Thủ tướng Chính phủ ban hành cơ chế, chính sách tài chính đối với khu kinh tế cửa khẩu.